由于飼養(yǎng)環(huán)境和雞糞肥排泄方式與其他畜禽不同，養(yǎng)殖戶習(xí)慣于露天晾曬雞，進(jìn)而導(dǎo)致蛆蟲(chóng)大量繁殖，產(chǎn)生臭味問(wèn)題。另外，由于生雞糞濃度高、價(jià)格低廉，農(nóng)民常使用未發(fā)酵的生雞糞作為農(nóng)作物（果樹(shù)）的肥料。當(dāng)它與水接觸時(shí)，會(huì)再次發(fā)酵并產(chǎn)生惡臭，形成臭味和蒼蠅滋生的環(huán)境。衛(wèi)生問(wèn)題以及對(duì)病原菌傳播的擔(dān)憂也會(huì)因施肥不當(dāng)而影響作物生長(zhǎng)，導(dǎo)致土壤線蟲(chóng)的出現(xiàn)。因此，農(nóng)民在考慮肥料分配和投入成本的同時(shí)，也須面對(duì)施用生雞糞的不良后果。
     為了減少生雞糞對(duì)環(huán)境衛(wèi)生的影響，雞糞在施用前需要進(jìn)行適當(dāng)?shù)亩逊屎桶l(fā)酵。但傳統(tǒng)的堆肥方法處理雞糞，容易產(chǎn)生臭味，費(fèi)時(shí)、費(fèi)力、需要處理空間。此外，部分氮會(huì)以氨（NH3）的形式損失。農(nóng)民普遍認(rèn)為肥料不如生物質(zhì)有效。雞糞使用成本較高，因此其應(yīng)用不如生雞糞普及。另一方面，雞糞堆肥時(shí)產(chǎn)生的臭味對(duì)附近居民影響較大。多年來(lái)，畜牧場(chǎng)、堆肥場(chǎng)成為公眾的“鄰避設(shè)施”，引發(fā)公眾抗議和臭味事件投訴會(huì)時(shí)不時(shí)聽(tīng)到。